SDS-PAGE که مخفف Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis است، یک تکنیک آزمایشگاهی پرکاربرد برای جداسازی پروتئین ها بر اساس اندازه آنهاست. این یک نوع تکنیک الکتروفورز ژل است که به طور خاص برای پروتئین ها طراحی شده است.

تهیه ژل:

یک ژل پلی آکریل آمید با غلظت گرادیان یا یکنواخت تهیه می شود. ژل به عنوان یک ماتریکس متخلخل عمل می کند که از طریق آن پروتئین ها مهاجرت می کنند.

دناتوره شدن پروتئین:

نمونه پروتئین با محلولی حاوی SDS (سدیم دودسیل سولفات) و یک عامل کاهنده (معمولاً بتا مرکاپتواتانول) مخلوط می شود. SDS پروتئین ها را می پوشاند و به آنها یک بار منفی یکنواخت می دهد و آنها را به زنجیره های خطی دناتوره می کند.

بارگیری و اجرای ژل:

نمونه پروتئین تیمار شده با SDS در چاهک های بالای ژل بارگذاری می شود. سپس یک جریان الکتریکی در سراسر ژل اعمال می شود. پروتئین ها به سمت الکترود با بار مثبت (آند) مهاجرت می کنند.

جداسازی بر اساس اندازه:

پروتئین ها با سرعتی که بر اساس اندازه آنها تعیین می شود در ماتریس ژل حرکت می کنند. پروتئین‌های کوچک‌تر سریع‌تر حرکت می‌کنند و به دورتر مهاجرت می‌کنند، در حالی که پروتئین‌های بزرگ‌تر آهسته‌تر حرکت می‌کنند و نزدیک‌تر به مبدا می‌مانند.

رنگ آمیزی:

پس از الکتروفورز، ژل معمولاً با رنگی مانند Coomassie Brilliant Blue رنگ می شود که به پروتئین ها متصل می شود. این اجازه می دهد تا باندهای جدا شده تجسم شوند.

تحلیل و بررسی:

الگوی نوارهای حاصل روی ژل نشان دهنده پروتئین های جدا شده است. با مقایسه نوارها با استانداردهای شناخته شده یا نمونه های دیگر، محققان می توانند اندازه پروتئین های نمونه را تخمین بزنند.​